Adapun yang menjadi hambatan dalam penelitian ini diantaranya kurangnya partisipasi sebagai pihak untuk dapat aktif dalam program kota tanpa kumuh, kurangnya pengawasan dalam program kota tanpa kumuh oleh instansi dan pihak yang seharusnya bekerja sesuai dengan tupoksinya dan ada beberapa kegiatan kegiatan yang tidak sesuai rencana.